Свій перший матч у першому чемпіонаті України підопічні Анатолія Пузача провели в наступному складі: Мартінкенас, Лужний, Волотьок (Юрій Мороз, 73), Безсмертний, Шматоваленко, Грицина, Анненков, С.Заєць, Саленко, Сукіасян, Квіткаускас (Шаран, 70). Дебютний гол киян на рахунку Юрія Грицина, який влучив у ворота «Металіста» уже на 3-ій хвилині.

У фіналі чемпіонату «Динамо» очікувала сімферопольська «Таврія». Кримчанам удалось випередити фаворита своєї групи «Шахтаря». Зрозуміло, що більшість фахівців віддавали перевагу «біло-синім». Проте гол Шевченка, забитий на 75-ій хвилині, так і залишився єдиним забитим м'ячем за весь поєдинок. Львівський стадіон «Україна» став щасливим для «Таврії», у складі якої виступав майбутній лідер «Динамо» Олександр Головко.

Склад киян у фінальному матчі: Мартіненкас, Лужний, Безсмертний (Матвєєв, 55), Алексаненков, Шматоваленко, Ковалець, Юрій Мороз, Заєць, Саленко, Беца, Шаран (Гріцина, 75). Наступний чемпіонат виявися для «Динамо» «золотим». У важкій боротьбі з «Дніпром» кияни стають першими за додатковими показниками. На перші ролі в команді виходять Віктор Леоненко, Сергій Мізин, розпочинає свою блискавичну кар'єру в формі «біло-блакитних» Сергій Ребров; на правому фланзі непрохідною стіною виглядає капітан Олег Лужний. У фіналі Кубка України голи Леоненка та Топчієва приносять динамівцям перемогу над «Карпатами». У новітній історії команди з'являється перший дубль.

У середині сезону трагічна звістка надходить з Дніпропетровську. Неподалік від міста в авіакатастрофі гине гравець «Динамо» Степан Беца.

У Єврокубках чекають дві болючі поразки від бельгійського «Андерлехта» та виліт із Кубка.

Влітку 1993 «Динамо» знаходиться на межі банкрутства. Фінансова ситуація в клубі критична. Відбувається зміна керівництва і на чолі «біло-синіх» стає відомий бізнесмен Григорій Суркіс, котрий разом із командою однодумців не лише рятує клуб від грошового краху, а й розпочинає піднімати інфраструктуру на новий якісний рівень. Будується база європейського рівня, динамівська школа…

Тривалий час динамівці монополізують чемпіонський титул в Україні. Вісім разів поспіль кияни на вершині, гравці «Динамо» становлять кістяк національної команди. Відбувається зміна поколінь, у перші ряди виходять вчорашні юніори: Олександр Шовковський, Владислав Ващук, Юрій Дмитрулін, Андрій Шевченко, чудово вписались у гру колишні дніпропетровці Юрій Максимов, Дмитро Михайленко, Євген Похлєбаєв, Сергій Коновалов, Сергій Беженар; заграли запрошені із «Таврії» Олександр Головко та із «Ниви» Віталій Косовський. Виокремлюються декілька трансферів, здійснених динамівським керівництвом.

На милицях перевезений до Києва блискучий російський плеймейкер Юрій Калитвинцев. Президент «Динамо» ризикнув інвестувати в футболіста з важкою травмою - і не прогадав! Після повного одужання Юрій став справжнім лідером команди, мозковим центром півзахисту та улюбленцем динамівських уболівальників. Калитвинцев прийняв українське громадянство та залишив помітний відбиток в історії національної команди.

Далі із Мінська запросили Валентина Белькевича й Олександра Хацкевича. Мабуть, немає необхідності розповідати про ту роль, яку ця парочка зіграла в успіхах команди у другій половині 90-х.

Проте головний «трансфер» керівники "Динамо" здійснили в сезоні 1996/97. Із близькосхідного «відрядження» до рідної команди повернувся Валерій Лобановський. Великий тренер не лише продовжив чемпіонську серію «біло-синіх», а й вивів команду на новий якісний рівень, а саме у число провідних клубів Європи. І як грали динамівці наприкінці 90-х! Перемоги над «Реалом», «Барселоною», «Арсеналом», вихід у пів- та чвертьфінали Ліги Чемпіонів.

Справжньою трагедією для динамівців став півфінал ЛЧ проти «Баварії». При повній перевазі в домашньому матчі, кияни не змогли обіграти опонента, не зумівши зберегти перевагу. У тому поєдинку українська команда виглядала наступним чином: Шовковсьий, Лужний, Головко, Ващук, Каладзе, Гусін, Хацкевич (Кірюхін, 80), Белькевич, Косовський, Шевченко, Ребров. У матчі-відповідь чудо-гол Маріо Баслера приніс перемогу мюнхенцям…

Відразу ж після найкращого сезону у новітній історії клубу команду покинув Андрій Шевченко. Вихованець "Динамо" перебрався до «Мілану», де провів чимало видатних сезонів, вигравав скудето, кубок чемпіонів, отримав «Золотий м'яч». Через рік на Захід переїхали Сергій Ребров та Каха Каладзе.

Якщо поєдинки з «Баварією» були футбольною трагедією, то події травня 2002 року стали трагедією загальнонаціонального масштабу. 13 травня пішов з життя один із найвідоміших українців, видатний тренер та велика особистість. У запорізькій лікарні помер Валерій Лобановський. В історії «Динамо" розпочалась нова епоха…

… Розпочалася втратою чемпіонського титулу. В кінці сезону динамівці поступаються у матчі своєму головному супернику «Шахтарю» та дозволяють гірнякам обійти себе. Свого донецька команда не упустила.

Тренером "Динамо" стає Олексій Михайличенко. Один з найкращих напівзахисників в історії команди виграє з «біло-блакитними» два чемпіонських титули у якості наставника. На перших ролях у киян цілий ряд легіонерів, які почали з'являтися в команді з 2000 року. Першим став угорець Ласло Бондар. Потім до Києва перебрались Горан Гавранчич та Георгій Пєєв.

У команді під керівництвом Михайличенко продемонстрували блискучу гру Діого Рінкон, уже згаданий Гавранич, румунська парочка Чернат-Гіоане, до снайперських рекордів підкрадається Максим Шацьких. Динамівці отримують серію красивих перемог у Лізі чемпіонів (у числі переможених «Ньюкасл», «Фейєнорд», «Локомотив», «Арсенал»), проте з групи вийти не вдалось. Щоразу нашій команді не вистачало найменшого, і, здавалось, що скоро ця серія буде обірвана…

Сезон 2004/05 динамівці розпочинають із прикрої домашньої поразки від «Шахтаря», а після того, коли на своєму полі в кваліфікації Ліги чемпіонів поступаються «Трабзонспору», Михайличенко відправляють у відставку. На правах «виконуючого обов'язки» його наступником стає легендарний динамівець Йожеф Сабо. При ньому команда виходить у груповий етап ЛЧ, перемагає "Рому" та "Байєр", втрачає очки у домашньому поєдинку з «Реалом», але після поразки в Леверкузені відправляється на Кубок УЕФА. Лютневий футбол був більше на руку іспанському «Вільярреалу»: левантійці вистояли в Києві та обіграли динамівців на «Ель Мадригалі».

«Біло-сині» програють чемпіонську гонку і влітку 2005 року, коли команду очолив Леонід Буряк. Невдало…

Колишній захисник киян 80-х років налагодив гру команди, динамівці видають серію перемог і взимку 2005 року Анатолій Васильович стає повноправним наставником. Але, на жаль, знову втрачено чемпіонський титул. «Біло-сині» незрозумілим чином втрачають можливість виграти вдома в «Шахтаря», не зумівши зберегти перевагу. У «Золотому матчі» гірняки перемагають у додатковий час.

Відразу ж після завершення чемпіонату ряд динамівців відправились до національної команди. Збірна України під керівництвом великого у минулому гравця нашої команди Олега Блохіна добилась найбільшого у своїй історії успіху: вийшла до фінальної частини чемпіонату світу. Далі ще більше! Українці виходять до чвертьфіналу. Ключові ролі зіграли динамівці: Олександр Шовковський, Владислав Ващук, Андрій Несмачний, Руслан Ротань, Артем Мілевський, Олег Гусєв, Сергій Ребров, а також колишні гравці "Динамо" Андрій Гусін, Володимир Єзерський, Андрій Шевченко.